基于贝叶斯稀疏因子预测模型流程图

基于多特征融合预测模型流程图

传统的药物研发遵循一种药物对应一个靶点的策略，而疾病的发生通常是由于系统水平上的异常。因此，人们提出基于系统生物学的思想进行药物研发，基于生物通路的药物研发策略正是这种思想的重要体现。识别药物和通路之间的关联是基于通路进行药物研发的重要一步。关于2019级博士研究生王纯纯在生物通路靶向药物治疗方面取得进展，成果形成学术论文“Drug-pathway association prediction: from experimental results to computational models”。

论文介绍了药物研发的背景以及药物和生物通路关联的概念，介绍了一些在药物和生物通路关联预测领域常用的数据库，系统地分析了近几年药物和生物通路关联预测的计算模型，并把它们分为三类：基于贝叶斯稀疏因子、基于矩阵分解和基于其他机器学习算法的模型。此外，论文梳理了几种用于评估计算模型预测性能的方法，讨论了现有计算模型存在的优点和局限性，并对数据收集和计算模型的未来发展方向提供了一些建议。